小陰莖：
　　妊娠第6周開始出現(xiàn)原始性腺，第8周原始性腺分化成功能性睪丸，具備了分泌睪酮的能力。性器官進一步分化的方向取決于胎兒在發(fā)育過程中有無一定數(shù)量的睪酮能力，即便是男胎兒，也必須要有適量的睪酮，才能保證胎兒性器官朝著男性分化發(fā)育。某些藥物或患慢性疾病，可使胎兒性器官發(fā)育受到抑制，如原發(fā)性曲細精管發(fā)育不全征(Klinefelter綜合征)的小陰莖，但這也可能是某種遺傳基因的影響，常有一條額外的“X”染色體(47XXY)，其發(fā)生率約為男性嬰兒的1/500。這種陰莖在解剖上是正常的，只是陰莖、睪丸都特別小，并伴有不育和性欲低下。
　　后天發(fā)育遲緩:
　　出生后在性器官發(fā)育期間，由于患慢性疾病致全身性營養(yǎng)不良，造成全身發(fā)育遲緩，性器官發(fā)育也受到抑制，成年后陰莖發(fā)育稍差，但功能正常。另一種是肥胖兒童，由于血睪酮含量稍低，陰莖發(fā)育遲緩，與同齡兒童相比差異明顯。從13歲起適當(dāng)給予小劑量睪酮，提高血睪酮濃度，有利于性器官的發(fā)育，與此同時必須節(jié)食，并加強身體鍛煉以利減肥。成年后若陰莖發(fā)育較差，同時影響夫妻性生活時，可作陰莖延長術(shù)。
　　包莖或包皮過長:
　　學(xué)齡前兒童仍為包莖或包皮過長時，將阻礙陰莖的正常發(fā)育。有些國家將每年的5月某日定為“包皮節(jié)”，凡是年滿5歲的男孩若有包皮過長癥，必須作包皮環(huán)切術(shù)。據(jù)統(tǒng)計，在青壯年陰莖發(fā)育不良的647例患者中，曾經(jīng)包莖或包皮過長者462例。陰莖的發(fā)育分為3個階段：胎兒分化發(fā)育;出生后至6歲為幼兒期發(fā)育;6歲后至12歲陰莖發(fā)育基本停滯，至13歲進入青春期階段，20歲陰莖發(fā)育成熟。家長應(yīng)密切觀察孩子陰莖的發(fā)育增長情況，并定期進行測量以作為觀察陰莖發(fā)育數(shù)據(jù)的比較。若在12-18歲期間，陰莖仍未見正常發(fā)育，應(yīng)適當(dāng)給予小劑量丙酸睪酮25-50mg，每周2次，每年治療兩個療程(2個月)，以促進陰莖的發(fā)育。若注射兩個療程仍無效時，應(yīng)檢查性染色體、血睪酮、促卵泡成熟素、黃體生成素、24小時尿17-酮類固醇及孕三醇的含量，以便排除Klinefelter綜合征或性別畸形。成年后或陰莖勃起短于10cm時，宜行陰莖延長術(shù)。