目前醫(yī)學上還不能確切知曉唇腭裂的發(fā)生根源，通常有以下兩大原因：

　　(一)環(huán)境因素：母親懷孕早期(懷孕3個月以前)出現(xiàn)下述某種狀況可能會導致寶寶唇腭裂：
　　1.病毒感染：如孕婦上呼吸道感染、風疹等。
　　2.藥物作用：如服用抗癲癇藥、類膽固醇、抗過敏、抗癌藥物等。
　　3.內(nèi)分泌：精神性或損傷性因素，如遭到強烈的精神刺激、身體外部遭損傷等。
　　4.營養(yǎng)因素：早孕期嘔吐，厭食，偏食等導致維生素D、葉酸、鐵、鈣等缺乏。
　　5.其他因素：如照射X線，吸煙，酗酒，缺氧。

　　(二)遺傳因素：唇腭裂有相當部分是遺傳的，直系親屬有唇裂者，其后代發(fā)生該病的比率為４％左右。一般唇腭裂發(fā)生在第一胎的概率為1/600，如果第一胎是唇腭裂的在第二胎發(fā)生唇腭裂的幾率為3/100。